Приложения не будут отображаться в Gnome Shell, однако они отображаются на панели "Избранное" и могут быть найдены.
Например, если я ищу что-то написанное неправильно ("хром"), это ничего не показывает, однако, если я ищу что-то правильно ("хром"), отображается заголовок "Приложения". Это означает, что он правильно ищет приложения, но просто не отображает их.
Я использую OpenSUSE 12.1 x64 в виртуальной коробке VM.