Что-то еще пожирает ваши ключи, скорее всего, оконный менеджер. Зайдите в настройки и установите переключение виртуального рабочего стола на что-то другое.
Поведение, которое вы описываете, является стандартным (команды readline).
$ bind -p| grep -E 'forward|backward-word' |grep -v "^#"
"\e\e[D": backward-word
"\eOd": backward-word
"\e[1;3D": backward-word
"\e[1;5D": backward-word #<---- this
"\e[5D": backward-word
"\eb": backward-word
"\C-f": forward-char
"\eOC": forward-char
"\e[C": forward-char
"\C-s": forward-search-history
"\e\e[C": forward-word
"\eOc": forward-word
"\e[1;3C": forward-word
"\e[1;5C": forward-word #<----- and here
"\e[5C": forward-word
"\ef": forward-word
"\e[6~": history-search-forward