Вы должны быть в состоянии сделать это с помощью комбинации gparted (или другого разделителя) и clonezilla. Gparted доступен на большинстве live-компакт-дисков Linux, а clonezilla доступен как iso для создания live-cd.
Используйте gparted для создания целевых разделов NTFS и ext4 на диске емкостью 2 ТБ и clonezilla в экспертном режиме для клонирования разделов на новый диск.
Для расширения разделов ... вы можете создать их в нужном размере с помощью gparted. При этом выровняйте границы по "МБ", и я предлагаю создать их кратно 1024 МБ. Так что если вы хотите раздел 340 ГБ, он будет 340 x 1024 МБ.
Так как вы будете работать с разделами диска, вы можете сохранить TestDisk под рукой, если что-то пойдет не так. Он доступен предварительно на нескольких спасательных компакт-дисках или в репозиториях для большинства дистрибутивов Linux, поэтому при необходимости вы можете установить его на сеанс live.