Apache настраивается в значительной степени. Вы можете подавать документы из обычного каталога /var /www или из вашего домашнего каталога - или обоих, если хотите. Если вы новичок, то /var /www - это, вероятно, хорошее место для начала. Просто убедитесь, что вы сами им владеете, иначе у вас возникнут проблемы с редактированием ваших собственных веб-документов. Если вы единственный, у кого есть документы, попробуйте это (конечно, как root):
# chown -R myuserid:myuserid /var/www
Поскольку вы упомянули тему копий, рекомендуется делать резервную копию этого каталога, когда вы вносите изменения в сайт, поэтому я бы познакомился с "tar" или чем-то подобным.