У меня были Windows и Linux (Gentoo), установленные на отдельных жестких дисках, и проблем не возникало, пока Windows была на основном жестком диске. Или, по крайней мере, установщик Windows откажется устанавливать на любой диск, кроме основного (или на любой другой раздел, кроме первого), хотя я думаю, что вы можете поменять местами диски после установки и тем самым получить Windows на вторичный привод. Но я отвлекся.
В любом случае, дело в том, что, безусловно, должна быть возможность установить две ОС на отдельных дисках, но это не обязательно. Вы можете, если хотите, разделить один диск на разделы и установить Windows на один раздел и Linux на другой. (Это то, что я делаю). Инсталляторы некоторых дистрибутивов справятся с этим, я не уверен, является ли Mint одним из них. Если вы сделаете это, вы можете использовать свой второй диск только для данных. Возможно, вы захотите отформатировать его как NTFS, потому что он надежно читается и записывается как в Linux, так и в Windows.
Насколько это хорошая идея: чтобы получить максимально быстрое время доступа к диску (и продлить срок службы дисков), вероятно, лучше распределить нагрузку между двумя дисками. Поскольку у вас двойная загрузка, вы будете одновременно использовать системные файлы только одной ОС, поэтому имеет смысл размещать обе операционные системы на одном диске и раздел данных на другом. Таким образом, независимо от того, какую ОС вы используете, вы будете использовать оба диска. Альтернативный вариант: установка Windows (вместе с меньшим разделом данных) на один диск и Linux (вместе с другим разделом данных) на другой диск, вероятно, будет перегружать один диск больше, чем другой, в зависимости от того, в какую ОС вы загружаетесь - если вы не заботитесь о том, как вы распределяете свои файлы данных между двумя дисками (но кто хочет это сделать?).
