Есть несколько возможностей.
Один из них - настройки режима хранения в BIOS, старые материнские платы часто предлагали различные варианты представления физических портов в качестве логических контроллеров, некоторые из которых отключали бы некоторые порты.
Другая причина заключается в том, что хотя теоретически SATA должна иметь обратную совместимость, на практике некоторые контроллеры имеют ошибки, которые не позволяют им работать с более быстрыми дисками. Некоторые накопители имеют перемычку для снижения скорости, что может помочь (но те, которые я видел на дисках 6 Гбит / с, позволяют пропускать только 3 Гбит / с, а не 1,5 Гбит / с).
Другое - порты SATA на плате просто сломаны. Старое оборудование иногда дает сбой.
В конечном итоге вы можете обнаружить, что вам нужно использовать дополнительную плату контроллера, если вы не можете заставить бортовую работу работать.