Старый вопрос, но сначала попал на гугл и нет правильного ответа.
Эти файлы являются "блокировочными" файлами, обычно создаваемыми редактором. Файлы блокировки бывают разных форм, но и emacs
и joe
создают символические ссылки, названные как в вашем примере - as. # [Original-filename].
Блокировка файлов используется для предотвращения одновременного редактирования одного и того же файла несколькими экземплярами (например, 2 разных пользователя, желающих редактировать один и тот же файл).
Если вы бежите
$ joe netMHC3.2.py
будет создан файл блокировки с именем
.#netMHC3.2.py
Когда редактор закрывается, файл удаляется. Если редактор выходит из строя, он остается позади и становится "устаревшей блокировкой". Вы можете удалить файл вручную на этом этапе, но большинство редакторов предоставляют вам эту возможность автоматически при редактировании файла в следующий раз.