Я проверил это с Windows 10 (RS5, 1809) в виртуальной машине.
Сначала я создал папку «C:\My Data» в корне чистой установки, а затем переустановил (* 1-я переустановка) из Windows, выбрав опцию "Сохранить ничего".
«C:\My Data» остался нетронутым. Он также создал папку windows.old которая содержала только папку « Users » из предыдущей установки, что сделало меня более любопытным, поэтому я создал папки в нескольких других местах:
C:\Users\My Data , C:\Users\Me\My Data , C:\Windows\My Data , C:\Program Files\My Data
А потом снова переустановил так же.
C:\Windows\My Data , C:\Program Files\My Data исчезли.
Но C:\Users , содержащий C:\Users\My Data и C:\Users\Me\My Data был заархивирован в Windows.old
Кроме того, Windows.old из * 1-й переустановки также был утерян и заменен вышеуказанным Windows.old (содержащим более новую папку Users )
Таким образом, кажется, что он удаляет только папки, связанные с Windows , то есть C:\Windows , C:\Program Files и т.д., Оставляет все остальное нетронутым, а также создает резервные копии ваших C:\Users в Windows.old и любых старых Windows.old удаляется также.