Я использую программу MD под названием Macsimus, я запустил тестовую симуляцию, но я не вижу ни одного графика? Я вижу следующие комментарии на Cygwin
showcp - это /cygdrive /c /Users /Neena /Desktop /macsimus_2018_09_13 /macsimus /bin /showcp plot - это /cygdrive /c /Users /Neena /Desktop /macsimus_2018_09_13 /macsimus /bin /plot
Из инструкции на http://old.vscht.cz/fch/software/macsimus/
Graphics (blend, show, and some utilities) is available for
basic X11 without any other requirements.
Это означает, что вам нужно установить X-сервер. Вероятно, для вашей цели достаточно установить пакеты cygwin xinit и xterm и все остальные пакеты станут зависимыми.