Руфус разработчик тут.
Прежде всего, Rufus пытается четко отобразить разделы, которые он собирается удалить, с помощью двух основных приглашений, одно из которых запрашивает подтверждение того, что вы действительно хотите стереть диск (с указанием ВСЕХ разделов, которые может видеть Windows, а не только первое) и второе приглашение при обнаружении нескольких разделов, которое сообщает вам, что Rufus обнаружил более одного раздела, и спрашивает вас, действительно ли вы хотите удалить диск, содержащий несколько разделов.
Другими словами, вы получаете два очень заметных запроса, позволяющих вам отменить операцию, прежде чем Rufus сделает что-либо, поэтому трудно понять, откуда взялся ваш "без моего разрешения" , так как Rufus дважды спрашивает вас об этом, если ваш диск содержит более одного раздел, и хотя бы один раз, если есть только один раздел. Поэтому, пожалуйста, будьте внимательны, чтобы искажать представление о том, что делает Rufus (что очень легко проверить), когда он был очень спроектирован так, чтобы всегда запрашивать разрешение пользователя перед перераспределением диска.
Теперь, что касается вашего основного вопроса, то, что вы хотите сделать (сохранение разделов), не является функцией, которую мы планируем предоставить в Rufus. Это подробно описано в FAQ здесь и здесь. Поэтому, если вы хотите сохранить один из разделов вашего диска, я с уважением прошу вас использовать другую утилиту.
С другой стороны, если вас интересует добавление персистентности для образа "Live" в Linux, обратите внимание, что у нас есть запрос на улучшение для этого, который имеет низкий приоритет, но который мы планируем завершить в конце концов... Как только эта функция будет реализована, вы все равно не сможете сохранить разделы, но сможете выделить некоторое пространство в виде постоянного раздела.