Вам нужно будет запустить детектор краев.
Основной синтаксис
ffmpeg -i in.mp4 -vf "edgedetect=enable='gt(mod(t,60),57)',negate" -c:a copy out.mp4
Фильтр отрицания добавлен, так как выходные данные edgedetect - белые края на черном холсте,
Если параметры edgedetect не обеспечивают достаточно тонкую настройку, запустите фильтр свертки заранее.
ffmpeg -i in.mp4 -vf "convolution=0 -1 0 -1 5 -1 0 -1 0:0 -1 0 -1 5 -1 0 -1 0:0 -1 0 -1 5 -1 0 -1 0:0 -1 0 -1 5 -1 0 -1 0:enable='gt(mod(t,60),57)',edgedetect=enable='gt(mod(t,60),57)',negate" -c:a copy out.mp4