Есть ли способ перезагрузить файлы в WinMerge после внесения изменений?
Вы можете нажать F5 (обновить).
В качестве альтернативы настройте WinMerge для выполнения автоматического сканирования.
Проверьте настройки WinMerge в меню « Правка» → «Настройки» → «Редактор» → «Автоматическое повторное сканирование».
4.1. Повторное сканирование файлов
По умолчанию опция автоматического повторного сканирования включена на странице редактора параметров WinMerge. Повторное сканирование обновляет операции сравнения и слияния. Без повторного сканирования различия WinMerge не обнаруживают изменения, которые могут произойти в файлах во время сравнения, например, во внешнем редакторе.
Повторное сканирование происходит, когда вы выполняете определенные действия (например, объединение различий или редактирование файла) во время сравнения файлов. Если файл изменился, WinMerge отобразит диалоговое окно, сообщающее, что другое приложение обновило файл, и спросит, хотите ли вы перезагрузить файл.
Нажмите Да, чтобы перезагрузить файл перед продолжением, или Нет, чтобы игнорировать изменения и работать с ранее загруженной версией файла.
Если автоматическое повторное сканирование отключено или вы подозреваете, что файл мог измениться, мы настоятельно рекомендуем запустить обновление перед выполнением любой операции слияния: нажмите «Правка» → «Обновить» или кнопку на панели инструментов кнопки «Обновить» или нажмите клавишу F5.
Если результат слияния выглядит неверно, нажмите «Правка» → «Отменить» или нажмите Ctrl+Z, чтобы отменить слияние. Затем отсканируйте файлы и попробуйте снова объединиться.
(акцент мой)
Сравнение и слияние исходных текстовых файлов - Руководство по WinMerge 2.12