Это будет моим мнением, так как вы тот, кто несет риск, и, как показывают комментарии, есть несколько способов справиться с этим. Ведь вы уже представили два своих.
Если вы посмотрите статью в Википедии о RAID 6, в ней говорится:
По данным Ассоциации производителей сетевых систем хранения данных (SNIA), определение RAID 6 таково: «Любая форма RAID, которая может продолжать выполнять запросы на чтение и запись ко всем виртуальным дискам массива RAID при наличии любых двух одновременных сбоев диска. Несколько методов, включая вычисления с двойной проверкой данных (контроль четности и Рида-Соломона), ортогональные данные двойной проверки четности и диагональная проверка четности, были использованы для реализации RAID уровня 6 ".
Так что уровень RAID должен быть нормальным, даже если вы удалите два диска одновременно. Это сказало, что я не буду делать это. Удаление дисков может повлиять на производительность дискового массива (в зависимости от нагрузки), а также будет означать, что с дополнительной ошибкой вы можете поставить под угрозу весь массив.
Поэтому я предпочел бы заменить диск, который кажется хуже, подождать, пока завершится перестройка, и заменить второй диск.