Мне неизвестны какие-либо решения, предназначенные для запуска на хосте и резервного копирования виртуальных машин. Кто-то может знать решение, которое делает это.
Существуют серьезные технические проблемы с резервным копированием того, что по сути является одним большим VHD-файлом, и это сделает восстановление очень трудным и длительным, если вам нужно что-то вроде одного файла, восстановленного в гостевой системе. Существуют и другие потенциальные проблемы, например теневые копии томов, особенно если вы используете какие-либо базы данных.
Я настоятельно рекомендую вам запускать агенты резервного копирования на виртуальных машинах и выполнять резервное копирование каждого из них, как если бы они были полностью автономной системой. Это позволит вам восстановить один или другой из всех возможных способов. На самом деле нет никаких причин для резервного копирования хоста. Обычно это зарезервировано как просто гипервизор и может быть переустановлено довольно быстро. Если вы также решили сделать резервную копию хоста, вы должны убедиться, что ваши виртуальные машины хранятся в другом разделе, и вы не позволяете программному обеспечению резервного копирования прикасаться к ним.
Имейте в виду, что это просто для резервного копирования. Если вы пытаетесь достичь высокой доступности, в Server 2012 R2 есть несколько доступных вариантов.