Экспортируйте ваш домашний раздел с samba и смонтируйте его в windows. Вот как я это делаю.
Чтобы уточнить, если вы не хотите монтировать /home на диск, сделайте /home символическую ссылку на \yourmachine \home (при условии, что вы экспортировали свой домашний диск как '/home').
Например, у меня есть /Documents, указывающие на //Bliss /Documents под cygwin+bash, я вижу (в моем корневом каталоге):
Documents -> //Bliss/Documents/
В Windows (cmd.exe) с dir этот файл выглядит следующим образом:
<SYMLINKD> Documents [\\Bliss\Documents]
(Блаженство это имя для моего сервера).
в Windows я создаю это в root, используя cd'ing для root, затем (из bash - обратите внимание на одинарные кавычки вокруг имени пути Windows с обратной косой чертой).
cmd /c mklink /d Documents '\\Bliss\Documents'