Bash - сортировка по первому символу

Question

Я хочу отсортировать файл по первому столбцу, но начать сортировку нужно с 5 символов. Как я могу это сделать?

Мой файл:

"TTTTCTTACA"            1       1
"TTTTCTTACC"                    1
"TTTTCTTACT"    1       1
"TTTTCTTAGC"    1
"TTTTCTTATT"                    2
"TTTTCTTCAA"    1               1       1
"TTTTCTTCAG"    1               2       1
"TTTTCTTCAT"            1       2       2
"TTTTCTTCCT"                            2
"TTTTCTTCGG"                    2       2
"TTTTCTTCTA"                            1
"TTTTCTTCTG"            1
"TTTTCTTCTT"    1                       2
"TTTTCTTGAA"            1
"TTTTCTTGCT"    1               1       1
"TTTTCTTTAA"    1
"TTTTCTTTAG"            1       1
"TTTTCTTTCT"    1
"TTTTCTTTGC"    1
"TTTTCTTTGG"            1       1
"TTTTCTTTGT"    1       1       2       1
"TTTTCTTTTA"    1

Я пытался:

sort -k1,1 file | uniq -s 6 -w 5 

Конечно, это не работает. У сортировки Mayby есть флаги, но я их не нашел. У тебя есть идея?

Answer 1

ТЛ; др

sort -k1.5 file | uniq -s 6 -w 5

объяснение

Мой вид - это GNU coreutils 8.22. Страница руководства для моего вида показывает:

KEYDEF is F[.C][OPTS][,F[.C][OPTS]] for start and stop position, where F is a field number and  C
       a  character  position  in  the  field;  both are origin 1, and the stop position defaults to the
       line's end.

Итак, с помощью вашей текущей команды sort -k1,1 file использует первое слово для первого слова в качестве сортировки.

То, что вы хотите (для команды сортировки в любом случае):

sort -k1.5 file | uniq -s 6 -w 5

Это будет использовать пятый символ первого слова, который вы хотели.

Answer 2

файл $ sort -k2

"TTTTCTTCTA"                            1
"TTTTCTTCCT"                            2
"TTTTCTTACC"                    1
"TTTTCTTATT"                    2
"TTTTCTTCGG"                    2       2
"TTTTCTTCTG"            1
"TTTTCTTGAA"            1
"TTTTCTTACA"            1       1
"TTTTCTTTAG"            1       1
"TTTTCTTTGG"            1       1
"TTTTCTTCAT"            1       2       2
"TTTTCTTAGC"    1
"TTTTCTTTAA"    1
"TTTTCTTTCT"    1
"TTTTCTTTGC"    1
"TTTTCTTTTA"    1
"TTTTCTTCTT"    1                       2
"TTTTCTTCAA"    1               1       1
"TTTTCTTGCT"    1               1       1
"TTTTCTTCAG"    1               2       1
"TTTTCTTACT"    1       1
"TTTTCTTTGT"    1       1       2       1

---

файл $ sort -k2 | uniq -f 1

"TTTTCTTCTA"                            1
"TTTTCTTCCT"                            2
"TTTTCTTACC"                    1
"TTTTCTTATT"                    2
"TTTTCTTCGG"                    2       2
"TTTTCTTCTG"            1
"TTTTCTTACA"            1       1
"TTTTCTTCAT"            1       2       2
"TTTTCTTAGC"    1
"TTTTCTTCTT"    1                       2
"TTTTCTTCAA"    1               1       1
"TTTTCTTCAG"    1               2       1
"TTTTCTTACT"    1       1
"TTTTCTTTGT"    1       1       2       1