Возникла та же проблема, Android Studio открывает все проекты, открытые при выходе!
Половина ответа присутствует при снятии флажка автоматического открытия при запуске AS в настройках AS
Таким образом, без автоматического открытия проекта Android Studio запускается с «плохим» пользовательским интерфейсом, плохим окном запуска Android Studio, но с предоставлением списка выбора недавних проектов в левой части окна ;-), просто нажмите на нужный проект, а затем давайте идти!
Используя первую часть выше (снимите флажок с автоматическим открытием) и в Windows (Win7 для меня), создайте ярлык для приложения Android Studio; откройте свойства ярлыка, затем добавьте путь к .idea\workspace.xml
вашего проекта в командную строку, например, C:\Android\android-studio\bin\studio64.exe D:\02-Android\minimalistApp\.idea\workspace.xml
затем закройте с помощью кнопки OK, чтобы подтвердить изменения!
Теперь, когда вы (дважды) нажмете на этот ярлык, Android Studio запустится в 2 этапа: минимальный пользовательский интерфейс, тогда ваш проект будет запущен.
Конечно, вы можете создать столько разных ярлыков, сколько хотите для целевого проекта!