Это связано с выравниванием разделов. По сути, под капотом ваш жесткий диск разделен на сектора. Всякий раз, когда жесткий диск выполняет операцию, он воздействует на весь сектор сразу; то есть, когда он читает любые данные, хранящиеся в секторе, он должен читать весь сектор. Если данные разбиты на несколько секторов, они должны прочитать весь каждый из этих секторов. Файловая система, которая идет по разделу, также распределяет доступное пространство по блокам (размер которых обычно является настраиваемым параметром при создании файловой системы; для FS, которая будет состоять в основном из небольших файлов, вы будете использовать небольшой размер блока, для чего-то в первую очередь При большом размере вы будете использовать большой размер блока, цель которого состоит в том, чтобы минимизировать потерянное пространство - если файл меньше размера блока, остальная часть блока теряется, но чем меньше размер блока, тем больше таблицы, адресованные всем блоки должны быть).
Теперь, по сути, вам нужно, чтобы блоки вашей файловой системы и секторы диска были выровнены - один должен помещаться в другой без остатка, и, что самое важное, они должны начинаться в одном месте, чтобы не было частичного перекрытия. Допустим, у вас есть диск с размером сектора 4 КБ, а ваша файловая система состоит из блоков по 1 КБ. Если ваш раздел начинается с небольшого смещения от начала сектора - даже если это всего лишь несколько байтов - каждый четвертый блок в вашей файловой системе будет фактически разделен на два сектора, поэтому вы должны читать / записывать оба сектора на диске при каждом взаимодействии с этим блоком. Это накладные расходы на 25%, которые могут быстро привести к значительному снижению производительности. Если размер вашего блока распределения FS такой же, как размер сектора HD (4k не будет необоснованным для обоих), и у вас есть это смещение, каждая проблема чтения / записи будет иметь эту проблему, что будет иметь огромное влияние на производительность.
Чтобы избежать этого, мы консервативно выравниваем начало разделов по границам в мегабайты (поскольку мегабайт должен все же быть большим кратным размеру блока / сектора даже через несколько лет с любыми массивными дисками, которые у нас будут). Это может привести к крошечным "пробелам" на диске, если размеры разделов также не совпадают и заканчиваются точно на границе мегабайта. В начале диска всегда остается пробел, потому что первые несколько секторов на диске зарезервированы для других целей.
https://www.thomas-krenn.com/en/wiki/Partition_Alignment описывает проблему более подробно. Однако, как указывалось, потерянное пространство по сравнению с размером современного диска довольно тривиально.