Я понял. Проблема возникает только с фотографиями, сделанными моей Lumia 950, особенно с теми, которые используют Rich Capture. Фотографии, сделанные в ручном режиме, или с моей более старой Lumia 920, которая не поддерживает Rich Capture, не имеют этой проблемы и могут быть просто перезаписаны. Я только недавно переключил телефоны, поэтому раньше не замечал проблемы.
Таким образом, в основном приложение Windows 10 Photos не позволяет сохранять поверх изображений, снятых телефоном Lumia в режиме Rich Capture:
Решение очень простое - переименуйте файл, чтобы удалить часть "Rich" из имени файла. Это заставляет кнопку Save появляться снова:
Следующий фрагмент PowerShell может быстро переименовать все файлы в папке:
gci | ren -newname { $_.name -replace "_Rich", "" }