Вопросы производительности в лучшем случае незначительны на очень быстром диске. Я делал это годами и не заметил, чтобы производительность страдала или улучшалась в любом случае. Я не бенчмарк, это пустая трата времени, когда я знаю, что я купил высокопроизводительное оборудование для начала.
Теперь, делая это на том же жестком диске, но на отдельных разделах, производительность будет не такой высокой, как на отдельных дисках. Но опять же, производительность не является основной причиной, почему вы хотели бы сделать это.
Основная причина заключается в том, чтобы отделить ваши данные от вашей операционной системы и программ. Вот почему многие системы Unix имеют /home как отдельную файловую систему. Обновления ОС не мешают вашим данным. Я построил свои системы, где "Program Files" находились в отдельном разделе того же диска, на котором была установлена ОС, и мои данные полностью находились на отдельном диске. Это сделало переустановку ОС легкой, но эта практика устарела в более новых ОС Windows. Я не устанавливаю много дерьмовых программ, так что моя ОС не становится хитрой, поэтому мне не нужно переустанавливать каждые 6 месяцев до года :-).
В настоящее время с высокоскоростным гигабитным Ethernet и базой для шумных серверных систем я храню свои данные в отдельной физической системе. Большая часть данных, к которым я обращаюсь, является мультимедиа для воспроизведения на моем HTPC, и гигабит идеально подходит для потоковой передачи.