Укажите поддерживаемый процессор x64. Кто знает, что QEMU по умолчанию.
Как то так (требуется KVM):
qemu-system-x86_64 -cpu host -m 2048 -boot d -hda coeess_virtual.img -cdrom en_windows_server_2012_r2_x64_dvd_2707946.iso
Или это (не требует KVM):
qemu-system-x86_64 -cpu Nehalem -m 2048 -boot d -hda coeess_virtual.img -cdrom en_windows_server_2012_r2_x64_dvd_2707946.iso
Список с поддерживаемыми значениями может быть запрошен
qemu-system-x86_64 -cpu "?"
Обновление:
Ах да, забыл предупредить вас: это все еще может не сработать. QEMU подходит для текущих версий Linux и старых версий Windows, но, вероятно, он не будет работать под управлением Windows 8+ без поддержки KVM.