Бинты должны выполнять то, что вы пытаетесь сделать. Вы можете легко использовать bind mounts в fstab: запись bsta mount выглядит так:
/path/to/original /mount/point none bind 0 0
Просто обратите внимание, что для начала вам нужно что-то подключить к /, поэтому я бы порекомендовал монтировать ваш SSD в /, а затем привязывать монтирование различных каталогов с вашего жесткого диска, как вам удобно.
Таким образом, fstab, как (предполагая ext4 разделы, изменить при необходимости)
### /etc/fstab ###
# Mount SSD to /
/dev/disk/by-uuid/your-ssd-partition-uuid / ext4 0 1
# Mount HDD somewhere (in this case /mnt/hdd)
/dev/disk/by-uuid/your-hdd-partition-uuid /mnt/hdd ext4 0 2
# Bind mounts
/mnt/hdd/var /var none bind 0 0
/mnt/hdd/srv /srv none bind 0 0
/mnt/hdd/tmp /tmp none bind 0 0
У вас также может быть выделенный "корневой" каталог для /, скажем, на вашем ssd, это сделает fstab похожим на
### /etc/fstab ###
# Mount SSD somewhere
/dev/disk/by-uuid/your-ssd-partition-uuid /mnt/ssd ext4 0 1
# Mount HDD somewhere (in this case /mnt/hdd)
/dev/disk/by-uuid/your-hdd-partition-uuid /mnt/hdd ext4 0 2
# Mount /
/mnt/ssd/root / none bind 0 0
# Other Bind mounts
/mnt/hdd/var /var none bind 0 0
/mnt/hdd/srv /srv none bind 0 0
/mnt/hdd/tmp /tmp none bind 0 0
/mnt/ssd/lib /lib none bind 0 0
/mnt/ssd/usr /usr none bind 0 0