Тот же вопрос был подтвержден как ошибка, и на него был дан ответ в этом сообщении об ошибке в Octave Bug , которое перенаправляет на это сообщение на форуме. Цитирую ответ, данный Джейсоном Николсоном как есть:
  Ключевым моментом является то, что переменная окружения "bell-style" должна быть установлена в "none" для MSYS, который поставляется с Octave.  Есть два других варианта "слышимый" и "видимый".  Обратите внимание, что параметр "visible", по-видимому, дает тот же результат, что и "слышимый" в Octiave 3.6.4, скомпилированной с Visual Studio, и выпуск msys/bin/sh.exe версии 3.1.17(1)(i686-pc-msys). ,  
  
  1- Вам нужно отредактировать Octave-3.6.4\share\octave\3.6.4\m\startup\inputrc
  2- Добавьте это в конец inputrc:
  
  ## Disable the beep!
  set bell-style none
  
  3- Перезапустите Octave и убедитесь, что он отключен.
  
  Я знаю, что в ближайшие годы некоторые найдут эту ветку, и процедура будет немного другой.  Бьюсь об заклад, ключ будет найти файл "inputrc".