Если вы хотите конвертировать их в GIF-файл, используйте ffmpeg вместе с конвертированной магией изображения.
Или просто используйте ffmpeg, чтобы преобразовать его в любой другой формат видео.
Вот как конвертировать из FLI в GIF как скрипт:
FILE="oldfile.fli"
# get frames per second of original file
FPS=$(ffmpeg -i "$FILE" 2>&1| sed -n '/tbr/s%.*\ \([0-9\.]\+\)\ tbr.*%\1%p')
# get delay for image magick animated-gif-creation in hundredths of second
DELAY100=$(awk 'BEGIN {print '100/$FPS'}')
# extract video to PNG images
ffmpeg -i "$FILE" "${FILE%.*}"%05d.png
# create gif file
convert -delay $DELAY100 ${FILE%.*}"?????.png -loop 0 output.gif
# optionally optimize the GIF file with gifsicle
gifsicle --colors 256 -O3 output.gif -o better_output.gif