Двоичные файлы для Ubuntu 12.04 x86 могут работать (может, не будет); но если они этого не делают, это из-за связи с библиотеками, которые изменились несовместимо между 2010 и 2012.
Пользовательское пространство CentOS / Red Hat Enterprise Linux серии 6.x основано на Fedora 12, начиная с конца 2009 года и до начала 2010 года. Ubuntu 12.04 была выпущена в апреле 2012 года, и большинство ее библиотек использовали версии, выпущенные в конце 2011 года. Таким образом, между CentOS 6.x и Ubuntu 12.x есть примерно 24-30 месяцев разработки.
Если что-то в glibc
(или в libstdc++
особенно) с тех пор заметно изменилось, Clang или что-либо на основе LLVM не будет работать, если оно было скомпилировано для Ubuntu 12.04 и работает на CentOS 6.x.
Я не могу сказать наверняка, потому что я не проверял это.
Вместо этого вам следует либо скомпилировать LLVM и Clang самостоятельно в CentOS 6.3, либо искать репозиторий, в котором поставляются двоичные файлы Clang для CentOS, например ELRepo.