ISO - это неправильный формат для жестких дисков - вам нужен какой-либо вид разреженного образа диска или формат, предназначенный для жестких дисков.
DD - немного старомодная школа, но делает немного идеальные копии дисков - подумайте об использовании одного из ориентированных на спасение вариантов из Linux или той или иной сборки для Windows.
Если вам нужно простое решение для резервного копирования и восстановления, создайте образ диска с помощью clonezilla и восстановите по мере необходимости.
В идеальной ситуации для систем x86 вы бы хотели конвертировать их в виртуальные машины - в vmware есть инструмент для этого в windows, или вы можете использовать базовую версию prodiscover для этого, я полагаю.
Вы можете смонтировать vmdk с помощью vmware diskmount, как мне кажется, или смонтировать образ dd с помощью fileddisk. Вышеупомянутое prodiscover должно позволять вам читать и копировать файлы из любого из них. VMDK - лучший выбор для imo, но базовый образ dd гораздо более совместим.
Все эти параметры приведут к тому, что образы дисков будут идентичны оригиналам, к которым вы можете получить доступ. Подумайте о том, чтобы хранить эти сжатые файлы, поскольку они, вероятно, будут большими.