Это примерно так же безопасно, как запуск любого другого стороннего приложения для запуска произвольного файла.
Допустим, вы идете на www.dodgysite.notreal, и у вас появляется всплывающее окно с просьбой запустить внешнее приложение без запроса, нажать «ничего не делать» и работать как в аду. В худшем случае вы запускаете приложение с известной уязвимостью, и ваша система подвергается риску.
С другой стороны, это произойдет, если вы запустите любой тип файла, который не обрабатывается chrome или явно объявлен безопасным. Это просто проверка типа здравомыслия, предупреждающая о том, чтобы не запускать случайную чушь Таким образом, пока вы действительно нажимаете и запускаете магнитную ссылку с достаточно надежного сайта, вы должны быть в безопасности.