В настоящее время я использую команду kill-session, но она выглядит несколько агрессивно и часто оставляет подпроцессы работающими, например, у меня следующие процессы выполняются в отдельных окнах tmux:
lighttpd -D -f ~/.lighttpd/default.conf # -D don't go to background
foreman # http://ddollar.github.com/foreman/
и всякий раз, когда я завершаю сеанс tmux, используя kill-session, эти процессы все еще выполняются, похоже, что по какой-то причине это отсылает их в фоновый режим, что немного неожиданно.