Я думаю, что это поможет.
Предупреждение - убедитесь, что вы понимаете последствия. После очистки ваша система не загрузится обратно в Windows. Вы почти наверняка захотите выполнить другую команду перед перезапуском - я приведу пример в конце. Я проверял это только на системах UEFI
Из командной строки с повышенными привилегиями выполните следующие действия:
bcdedit /createstore c:\emptystore
bcdedit /import c:\emptystore /clean
Если вы хотите, чтобы ваша система перезагружалась обратно в windows, установленный в c:\windows, вы должны запустить это из того же приглашения перед перезапуском:
bcdboot c:\windows