Ваши личные предпочтения, файлы поддержки приложений, кэши и т.д. В основном хранятся в ~/Library . Некоторые приложения (созданные на основе BSD) сохраняют скрытые файлы и каталоги непосредственно в ~ , другие загрязняют ~/Documents .
Ваши личные настройки пользователя (все, что вы делаете с defaults) находятся в ~/Library/Preferences/ . Некоторые приложения (SSH, bash и т.д.) По-прежнему хранят свои скрытые файлы настроек непосредственно в ~ , обычно вы можете использовать символическую ссылку или source для других.
Многие приложения хранят файлы поддержки (например, базы данных документов) в ~/Library/Application Support/ - это зависит от конкретного приложения, если файлы, хранящиеся там, имеют реальную ценность.
Некоторые приложения или подсистемы (Safari, Mail, дополнения QuickLook, Конфигурация принтера, персональные виджеты Dashboard) хранятся в подкаталогах ~/Library . Вы должны оценить их все по отдельности, чтобы определить, хотите ли вы сохранить их содержимое в системе контроля версий.
Это может быть полезным ресурсом здесь.
Я бы не рекомендовал переводить всю ~/Library в систему управления версиями. Есть тонны кешей и т.д.