Прежде всего, существует не одна база данных WHOIS, а множество разных серверов WHOIS. Каждый сервер WHOIS обычно предоставляет данные для одного или нескольких конкретных TLD. Вот довольно полный список доменов верхнего уровня и сервера WHOIS, который обрабатывает каждое из них.
Мне не известен инструмент, который может выполнять поиск в WHOIS и указывать регистратора в качестве критерия. Вам, вероятно, понадобится создать собственный скрипт для этого. Этот ответ на StackOverflow может помочь вам в этом.
Помните, что на серверах WHOIS используется ограничение скорости, поэтому вы сможете выполнять сравнительно небольшое количество поисков, прежде чем вас полностью ограничат или заблокируют.