Вы можете добавлять записи в /etc /fstab и комментировать их или в. Как это:
/dev/sda1   /    ext4   relatime,errors=remount-ro    0  1
/dev/sda5   none swap   sw                            0  0
#/dev/sda2  /foo ext4   none                          0  0
Вы можете закомментировать последнюю строку только тогда, когда вам это нужно, оставляя "по умолчанию" функционально неизменным.
Чтобы прямо ответить на ваш вопрос: нет, вы не можете использовать "альтернативный" файл fstab - вам придется изменить способ загрузки самой системы, чтобы сделать это. Однако некоторые системы поддерживают каталог /etc/fstab.d, куда вы можете добавить дополнительные файлы fstab. Я не знаю много об этом, вам нужно будет duckduckgo это.