Как я могу удалить те наложения, которые ставятся на каждый ярлык? Они немного раздражают, особенно на моем рабочем столе, потому что большинство значков являются ярлыками.

Две быстрые вещи, которые я нашел:
Загрузите Vista Shortcut Overlay Remover (FxVisor) из frameworkx. FxVisor позволяет либо изменить, либо удалить стрелку наложения ярлыка в Windows 7 и Vista. Вот скриншот этой утилиты:

Удаление стрелки быстрого доступа: загрузите blank_icon.zip и распакуйте файл blank.ico в папку по вашему выбору. В этом примере мы используем C:\Icons\blank.ico в качестве пути к загруженному файлу значка. А затем выполните следующие действия:
Перейдите к следующей ветке:
HKEY_LOCAL_MACHINE \ ПРОГРАММНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ \ Microsoft \ Windows \ CurrentVersion \ explorer \ Shell Icons
На правой панели создайте новое строковое значение (REG_SZ) с именем 29
Загрузите этот Reg-файл и следуйте инструкциям readme, включенным в zip-файл, чтобы удалить значок стрелки быстрого доступа. (Осторожно: я не писал этот файл рег!)
Чтобы также удалить часть ярлыка:
Найдите «Ссылка» в правой части редактора реестра.

Теперь попробуйте создать ярлык на рабочем столе, и он не должен показывать расширение ярлыка.
Я использовал Ultimate Windows Tweaker от Клуба Windows.