Вот пример.
$ gnome-terminal &
[1] 8521
$ Warning: DESKTOP_STARTUP_ID not set and no fallback available.
Я не получаю это предупреждение, если я запускаю новый терминал, используя "Открыть терминал" в меню "Файл" другого терминала. Такое поведение началось сразу после того, как я обновил Fedora 23 до 25.